调节脏腑及器官失衡导致的疾病
脏腑包括眼、耳、鼻、舌、口、二阴等九窍及其他功能结构相对独立的器官。由于先天缺陷或后天失养，或自然、社会等因素引起的虚实状态，并累及或传变相关脏腑，出现的诸多病症，都会在经络上反应出来，并能通过调整经络的方法，使其缓解或恢复正常。在《素问》的灵兰秘典论、六节藏象、五脏生成、五脏别论等篇章中有集中的论述。
(1)心与小肠
《素问·灵兰秘典》曰：“心者，君主之官也，神明出焉。”心主血脉，对精神意识思维活动具有主导作用。手少阴经为本藏的主管经脉，并通过本经分别与手太阳经、小肠，足少阴经、肾直接联系。在病理上，还分别与手厥阴经、手太阴经、足太阴经等有某些特定的联系途径。
如：心气虚常选用神门、少海调之;心火炽盛或浮火上越常选用少府、少海或加手太阳经的少泽治之;心阳不足者可选用神门、太溪、复溜调之。
且小肠承接经过胃初步消化的营养物，进一步分解转化为更精微的物质供人体吸收，功能上与心密切相关，大多以手少阴心经为主调理经络。
(2)肝与胆
《素问·灵兰秘典》曰：“肝者，将军之官，谋虑出焉。”意为肝具有解毒、疏导、调度气血平衡的重要作用，有藏血、主筋的功能。足厥阴经为本藏的主管经脉，并通过本经分别与足少阳经、胆，手厥阴经、心包直接联系。在病理上，还分别与足少阴经、足太阴经、冲脉、任脉等有某些特定的联系途径。
如：肝阴不足，常选用曲泉、太冲、曲泽治之;肝气郁结或郁热选用足少阳经的支沟、阳陵泉疏解，或取外关、足临泣治之。
胆在六腑中是一个特殊的腑，《素问·五脏别论》谓之奇恒之府，与脑、髓、骨、脉、胆、女子胞并列，皆为地气之所生，藏而不泻。有关本腑的功能理论，还有待进一步解读研究。
(3)脾与胃
《素问·灵兰秘典》曰：“脾胃者，仓廪之官，五味出焉。”意为脾胃配合，是人体一切营养的总来源。另外，脾还有统血、主一身肌肉的功能。足太阴经为本藏的主管经脉，并通过本经分别与足阳明经、胃，手太阴经、肺直接联系。在病理上，还分别与足少阴经、足厥阴经、任脉等有某些特定的联系途径。
如：脾虚选用太白、阴陵泉调之;脾湿常用阴陵泉、尺泽调之;脾胃不适选用手足三里治之;脾虚寒证取太白、太溪、建里、气海治之等。
胃病在实证、热证时常用曲池、足三里、中脘、内庭治之;在虚证、寒证时则选取太白、大都、隐白、天枢等腧穴治之。
(4)肺与大肠
《素问·灵兰秘典》曰：“肺者，相傅之官，治节出焉。”意为肺辅助心对人体各种节律和调节有重要的主宰作用，主一身之气。手太阴经为本藏的主管经脉，并通过本经分别与手阳明经、大肠(含食管)，足太阴经、脾直接联系。在病理上，还分别与手少阴经、手厥阴经、任脉等有某些特定的联系途径。
如：肺气虚常取尺泽、太渊补之;肺热常取尺泽、鱼际清之或曲池、列缺清之;肺脾两虚者，常取太渊、太白治之。
大肠除了特指消化道远端(包括盲肠、结肠、直肠外，还包括食管段，此点另以专文讨论)。大肠的病症大多与手太阴经有关联。同样手阳明经亦可调理手太阴经及肺的许多病症。
(5)肾与膀胱
《素问·灵兰秘典》曰：“肾者，作强之官，伎巧出焉。”意为肾有激发超常生理功能的作用，在生命的进行中，能产生奇异的维护保卫人体的作用，人体的免疫、特异功能都与肾有关。
肾藏精主骨生髓，对人的寿命有重要影响。足少阴经为本藏的主管经脉，并通过本经分别与足太阳经、膀胱，手少阴经、心直接联系。在病理上，还分别与足太阴经、足厥阴经、督脉、冲脉等有某些特定的联系途径。
如：肾虚常选用阴谷、太溪、复溜调之;肾为寒湿瘀阻常用肾俞、次髎、委中等穴治之。
膀胱在六腑中亦属于一个特殊的腑，《素问·灵兰秘典论》曰：“膀胱者，州都之官，津液藏焉，气化则能出矣。”此处要注意经文中的“津液藏焉，气化则能出矣。”这几个字，说明膀胱经对人体津液、体液的运行和代谢有重要调节作用，膀胱借助肾阳、命门之火与三焦腑共同对人体的津液布化、排出发挥决定性的调节作用。
(6)心包与三焦
《素问·灵兰秘典》曰：“膻中者，臣使之官，喜乐出焉。”心包亦称膻中，此处强调了心包的位置。意为心包是附属于心的一个脏，它执行心的一些功能，对人的情志舒缓、紧张有重要影响。手厥阴经为本藏的主管经脉，并通过本经分别与手少阳经、三焦，足厥阴经、肝有直接联系。在病理上，还分别与手少阴经、手太阴经、阴维脉等有某些特定的联系途径。
如：心包郁热，常用曲泽、大陵、劳宫治之;手足厥阴经郁、瘀时常用大陵、行间治之。
三焦腑也是一个更为特殊的大腑，历代文献对其都有研究论述，争辩不已。《素问·灵兰秘典论》记载：“三焦者，决渎之官，水道出焉。”意为三焦是人体最广泛的体液流通网络通道系统。
以上讨论了脏腑经络不可分割的关系，从中已经显示出手足十二经、奇经八脉对脏腑生理、病理、诊断、治疗的重要价值。除此外，表里经、同名经、生克经的理论更具临床意义，在此简略讨论如下。
一是表里经。凡表里经连接的脏和腑，体内位置上都有明显的临近性：肝和胆皆在右胁下;心与小肠皆在横膈上下;脾胃均在腹部;肾与膀胱皆在腰部、盆腔中;肺与大肠在胸部，部分大肠在腹部(关于大肠的称谓和位置另文讨论);心包与三焦主全身气血的运行和布化，功能上不能分离。
表里经所联系的脏与腑大多在营血供应、代谢排出方面具有共用或并行的结构。因此，在诊断治疗上，表里经理论都具有重要指导意义。针灸临床上选经配穴理论中“阴病取阳、阳病取阴、阴阳经并取”的治则就是据此建立的。
二是同名经。同名经是根据阴阳理论结合脏腑的生理、病理总结归纳出来的;概括了手足两经连接延续的特点，从而显示出所归属的两脏或两腑在生理、病理、诊断、治疗上的密切关系。针灸临床中，大量的同名经配穴组合就是据此理论建立的。
三是相生相克经。根据脏腑五行属性，在一定条件下，经络依其所属脏腑也能产生“有益”或“制约”的治疗作用，五输穴及其选经配穴就是据此理论建立的。后世建立的子午流注针法、灵龟八法等也与此有关，只是后者突出了时间对脏腑、对疾病、对治疗的决定性作用，这里不做讨论。
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